法律分析：不会的，依照法律规定，派出所已经立案的仍然会将案件移送审查起诉，然后向提起公诉，认为情节轻微的，也可以不起诉。当事人之间达成调解协议或者和解协议，属于从轻处罚情节；对于不起诉的，因是无罪处罚，不会留案底，如果派出所未刑事案件立案，而立的是治安案件，派出所调解后就有可能不移送起诉了，就不会有案底。
法律依据：《刑事诉讼法》第二百八十九条：“和解协议的审查与制作，双方当事人和解的，机关、人民、人民应当听取当事人和其他有关人员的意见，对和解的自愿性、合法性进行审查，并主持制作和解协议书。”第二百九十条：“和解协议的效力，对于达成和解协议的案件，机关可以向人民提出从宽处理的建议。人民可以向人民提出从宽处罚的建议；对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民可以依法对被告人从宽处罚。”