农村宅基地纠纷应先到乡镇或县级国土资源部门处理，不服可行政复议后到县级人民；涉及土地问题纠纷需持土地权属证明，可确定边界，侵权行为可向起诉；宅基地纠纷需由宅基地所在地法庭或受理。
法律分析
一、农村宅基地有纠纷找哪个部门解决
如果是宅基地权属纠纷，应该先到乡镇或县级国土资源部门进行处理，对处理的决定不服经过行政复议后，方可行政诉讼，应到县级人民。若是宅基地权属清楚、可以直接向宅基地所在地的县级人民提起诉讼。
乡土地所/县土地管理局/土地管理。我国的农村宅基由村上批，乡里备案，如果宅基地发生纠纷由乡级、县级相关部门负责仲裁。对仲裁不服的可以向基层人民提起民事诉讼。
二、涉及土地问题引起的纠纷应该如何处理呢?
1.首先你要证明这块土地你有使用权，而证明的办法只有一个，那就是土地权属证明。因为土地是不动产，其权属证明在我国是登记制，当事人必须持有土地权属证明才能证明你对这块土地有权利。颁发土地权属证明是的权力，没有取得这个证明前，是不能直接向人民起诉的。
2.如果双方都有土地权属证明，只是土地边界有交叉、界限不明等引起的纠纷，应当先由确定边界，这也是法律赋予的行政权力。
3.如果一方取得土地权属证明后，另一方在其土地上放置杂物、建房等影响其正常使用的情况，这就是明显的侵权行为了，协商不成时，就可以向人民起诉。
宅基地纠纷在农村很常见，有不少人认为只要有纠纷就去找，这是不对的，并不是什么纠纷都有权处理。受理涉及土地及相邻关系的民事案件范围主要为侵权纠纷、排除妨碍纠纷、或者返还原物纠纷。
《中华人民共和国土地管理法》第十四条第一款明确规定：土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决;协商不成的，由处理。
如果只是土地使用权争议，根据法律规定，无权处理。
宅基地案件按专属管辖的原则应当由宅基地所在地法庭或受理。把握立案时的审查只是根据原告的诉称作程序上的审查，并不做实体上的审查。经审查符合立案条件的立案受理，不符合条件的告知当事人到有管辖权的部门处理。坚持起诉的，裁定驳回起诉。
结语
农村宅基地纠纷的解决需要根据具体情况采取不同的途径。对于宅基地权属纠纷，应先到乡镇或县级国土资源部门处理，如不服处理决定，可进行行政复议后再向县级人民提起诉讼。如果宅基地权属清楚，可以直接向宅基地所在地的县级人民提起诉讼。涉及土地问题引起的纠纷处理方法包括：持有土地权属证明证明自己对土地有权利，确定边界，侵权行为可向起诉。需要注意的是，并非所有纠纷都适合处理，土地使用权争议应由当事人协商解决，若协商不成，由处理。宅基地案件应由宅基地所在地法庭或受理。
法律依据
中华人民共和国农业法（2012修正）：第八章 农业资源与农业环境保护 第五十九条 各级应当采取措施，加强小流域综合治理，预防和治理水土流失。从事可能引起水土流失的生产建设活动的单位和个人，必须采取预防措施，并负责治理因生产建设活动造成的水土流失。v各级应当采取措施，预防土地沙化，治理沙化土地。和沙化土地所在地区的县级以上地方应当按照法律规定制定防沙治沙规划，并组织实施。