法律分析：
单位追讨工程款的注意事项有：1.收集当事人诉讼主体资格的证据;2.保存好证明建设工程合同关系成立的证据;3.保存好证明建设工程合同履行情况的证据;4.提交诉讼请求的计算依据。
法律依据：
《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》 第六条 建设工程施工合同无效，一方当事人请求对方赔偿损失的，应当就对方过错、损失大小、过错与损失之间的因果关系承担举证责任。
损失大小无法确定，一方当事人请求参照合同约定的质量标准、建设工期、工程价款支付时间等内容确定损失大小的，人民可以结合双方过错程度、过错与损失之间的因果关系等因素作出裁判。