农保和医保在报销比例上的区别是农保报销在20--80%左右，而医保为70%左右。医疗保险的报销是按比例进行的，一般在70%左右浮动。其报销的比例和多少跟自己的检查和用药情况、医疗等级等因素有关。
《社会保险法》第二条国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。第二十四条国家建立和完善新型农村合作医疗制度。新型农村合作医疗的管理办法，由规定。