区别在于砗磲属于贝类动物。海磲属爬行物，海龟科的海洋动物。这是这两种最大的区别。
砗磲是海洋贝壳中最大者，生长在海洋深水，最大的可达2米。砗磲具有珍珠光泽，有晕彩和丝光，且质地光洁细腻，属于有机宝石。
海磲是有机宝石类。其用途广泛，长期以来为人们所喜爱。海磲特指玳瑁的背甲，为非晶质体，呈微透明至半透明，具蜡质至油脂光泽