正常硝化是NH3生成亚根NO2-，进而生成根NO3-。根在缺氧条件下，生产亚根，再进一步生产N2，称为反硝化。短程硝化是指NH3生成亚根，不再生产根；而由亚根直接生成N2，称为短程反硝化。短程硝化反硝化是指NH3---NO2----N2，即可以从水中氨氮去除的一种工艺。