在协议中的纠纷和违约问题，通常需要遵循以下步骤来处理：
1.审查协议条款：在发生纠纷或违约时，首先需要仔细审查协议条款，了解各方的权利和义务，判断是否存在违约行为。
2.尽早沟通：一旦发现问题，应尽早与对方沟通，寻求解决方案。如果双方无法协商达成一致，可以考虑寻求第三方的帮助，如中介组织、律师等。
3.调解协商：在沟通的过程中，可以尝试进行调解协商，以达成双方都能接受的解决方案。如果双方能够达成协议，应该将协议书面化，并严格执行。
4.法律救济：如果调解协商无法解决问题，可以考虑寻求法律救济。在提起诉讼之前，应该仔细研究协议条款，确认对方是否存在违约行为，以及自己是否存在过错。
在处理协议中的纠纷和违约问题时，需要遵循合法、公平、诚信的原则，保持冷静、理性，充分沟通，积极解决问题，以维护双方的合法权益。
参考来源：《合同法》、《民事诉讼法》等相关法律法规。