法律分析：根据《刑事诉讼法》第六十三条规定，机关在调查犯罪时，可以采取对犯罪嫌疑人的自由措施。但是，如果机关对嫌疑人进行无证拘留，则其行为属于违法行为，不仅会受到行政处罚，还可能涉及刑事责任。
法律依据：
1.《中华人民共和国治安管理处罚法》第二十五条：机关采取拘留、逮捕等强制措施，必须出具证件。
2.《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十三条：机关在调查犯罪时，采取对犯罪嫌疑人的自由措施，应当出示证件，并告知被人的权利和义务。
3.《中华人民共和国治安管理处罚法》第七十九条：机关对违反治安管理法规的人实行自由措施，必须出具证件。
4.《中华人民共和国刑法》第二百四十四条：违法拘禁罪，是指非法他人人身自由的行为。
综上所述，对于无证拘留的行为，机关应当受到惩罚，但无证拘留不会留下案底。