不算，若用户引用参考文献的格式设置正确，查重系统不会计算参考文献的重复率，而是计算参考文献的引用率是多少。查重系统在对参考文献查重时，会先识别参考文献的引用格式，若格式正确，查重系统会将参考文献的内容和引用库的内容进行比对，如果内容一致，查重系统就会判断这部分内容为参考文献部分，并不会计算其重复率是多少。